Publications

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Publications et communications 2022

Publications scientifiques

• BERROUCH, S., ESCOTTE-BINET, S., MADLINE, A., AUBERT, D., NAST, E., LA CARBONA, S., HOUMMADI, L., HAFID, J., VILLENA, I. 2022. Protozoan parasites and leafy greens in Marrakech: study of occurrence using a molecular method. Acta Parasitol, 67(1): 546-554.
• BIGOT-CLIVOT, A., LA CARBONA, S., CAZEAUX, C., DURAND, L., GEBA, E., LE FOLL, F., XUEREB, B., CHALGHMI, H., DUBEY, J.P., BASTIEN, F.,BONNARD, I., PALOS-LADEIRO, M., ESCOTTE-BINET, S., AUBERT, D., VILLENA, I., GEFFARD, A., 2022. Blue mussel (M. edulis) – a bioindicator of marine water contamination by protozoa: laboratory and in situ approaches. J Appl Microbiol, 132(1): 736-746.
• CAZEAUX, C., LALLE, M., DURAND, L., AUBERT, D., FAVENNEC, L., DUBEY, J.P., GEFFARD, A., VILLENA, I., LA CARBONA, S. 2022. Evaluation of real-time qPCR-based methods to detect the DNA of the three protozoan parasites Cryptosporidium parvum, Giardia duodenalis and Toxoplasma gondii in the tissue and hemolymph of blue mussels (M. edulis). Food Microbiol, 102: 103870.
• CHALMERS, R.M., KATZER, F., LA CARBONA, S., LALLE, M., RAZAKANDRAINIBE, R., ROBERTSON, L.J., ROBINSON, G., ŠOBAI, B., TEMESGEN, T., MAYER-SCHOLL, A. 2022. A guide to standardize artificial contamination procedures with protozoan parasite oocysts or cysts during method evaluation, using Cryptosporidium and leafy greens as models. Food Control, 134: 108670.
• LE GUERNIC, A., PALOS LADEIRO, M., BOUDAUD, N., DO NASCIMENTO, J., GANTZER, C., INGLARD, J.C., MOUCHEL, J.M., POCHET, C., MOULIN, L., ROCHER, V., WALDMAN, P., WURTZER, S., GEFFARD, A. 2022. First evidence of SARS-CoV-2 genome detection in zebra mussel Dreissena polymorpha. J Environ Manag, 301: 113866.
• WURTZER, S., LEVERT, M., DHENAIN, E., ACCROMBESSI, H., MANCO, S., FAGOUR, N., GOULET, M., BOUDAUD, N., GAILLARD, L., BERTRAND, I., CHALLANT, J., MASNADA, S., AZIMI, S., GUILLON-RITZ, M., ROBIN, A., MOUCHEL, J.M., OBEPINE SIG, MOULIN, L. 2022. Monitoring of SARS-CoV-2 variant dynamics in wastewater by digital RT-PCR: from Alpha to Omicron BA.2 VOC. Science Tot Env, 848: 157740.
• BORGES, F., BRIANDET, R;, CALLON, C; , CHAMPOMIER-VERGES, M-C., CHRISTIEANS, S., CHUZEVILLE, S., DENIS, C., DESMASURES, N., DESMONTS, M-H., FEURER, C., LEROI, F., LEROY, S., MOUNIER, J., PASSERINI, D., PILET, M-F., SCHLUSSELHUBER, M., STAHL, V., STRUB, C., TALON, T., ZAGOREC, M. 2022 Contribution of omics to biopreservation. Frontiers in Microbiology. PUBLISHED 02 August 2022. DOI 10.3389/fmicb.2022.951182

 Publications techniques

• HANIN, A., LEVERT, D., SOUMET, C., BRIDIER, A., ROUSSET, N., TRAVEL, A. 2022. Etude de la capacité des détergents enzymatiques à lutter contre les biofilms d’Escherichia coli. Animal Science Proceedings, sous presse
• SOUMET, C., AIT AHMED, A., LE GRANDOIS, P., ROUSSET, N., TRAVEL, A., HANIN, A., BRIDIER, A. 2022. Capacité des flores de barrière à limiter l’implantation et le développement de Salmonella typhimurium. Animal Science Proceedings, sous presse
• DEHAINE, S. 2022. Validation expérimentale de la nettoyabilité des équipements ouverts en industrie agro-alimentaire. Revue IAA mai-juin 2022, 24-25
• DENIS, C., STAHL, V.2022. Un réseau d’experts sur la qualité microbiologique des aliments. Revue Générale du froid, n°1183 septembre 2022, 23-28

Communications orales

•  LA CARBONA S. SACRYVEG : Survie et Adhésion des oocystes de CRYptosporidium spp. sur des matrices alimentaires VEGétales. 2ème Journée scientifique de la fédération de recherche régionale « Sécurité Sanitaire, Bien-être et Aliments Durables ». 09 novembre 2021. Communication orale.
• BICHET, M., ROBIN, M., HARTARD, C., GANTZER, C., BERTRAND, I., BOUDAUD, N. F-specific RNA phages can be used as indicators of noroviruses hazard in leafy greens and oysters. Virus of Microbes FEMS, July 18-22 2022, Guimaraes, Portugal. Communication affichée.
• BOUDAUD, N. OXYVIR 2 : danger à norovirus infectieux dans les coquillages. Commission sanitaire du Comité National de la Conchyliculture. Mai 2022, webinar. Communication orale.
• CHASSAING, M., ROBIN, M., LOUTREUL, J., MAJOU, D., GANTZER, C., BOUDAUD, N. Interaction between norovirus and histo-blood group antigens: is there a protective effect against pH and proteolytic enzymes ? International Society for Food & Environmental Virology, 16-20 mai 2022, Saint-Jacques de Compostelle (Espagne). Communication orale.
• LA CARBONA, S. Toxoplasma oocysts in foods: which methods to assess human exposure and implications for risk evaluation? 2nd Environmental Toxoplasmosis Workshop, 20-22 mai 2022, Riverside, CA, USA. Communication orale.
• KUBINA, S. Étude de la survie et de l’adhérence des oocystes de Cryptosporidium parvum sur une matrice alimentaire végétale: la mâche. Assemblée générale de l’Association Française des Enseignants et Praticiens Hospitaliers Titulaires de Parasitologie et de Mycologie Médicale (ANOFEL), 2022, Prix de thèse d’université 2021. Communication orale.
• KUBINA, S. Adhérence et survie de Cryptosporidium sur matrice végétale. Webinaire Recherche Société Française de Parasitologie, 14 juin 2022. Comm. Orale.
• LA CARBONA, S. Méthodes de détection des parasites protozoaires dans les aliments. Société Française de Parasitologie, 21-23 juin 2022, Rouen. Communication orale.
• AUGENDRE, L., ESCOTTE-BINET, S., AUBERT, D., SILVESTRE, A., REPERANT, J.M., VILLENA, I., DUMETRE, A., LA CARBONA, S. Évaluation des parasites protozoaires Eimeria spp. comme modèles d’étude de l’inactivation des oocystes de Toxoplasma gondii. Société Française de Parasitologie, 21-23 juin 2022, Rouen. Communication orale.
• YERA, H., MAISONNEUVE, E., ESCOTTE, S., DUMETRE, A., SAINTPIERRE, B., SCHAEFFER, C., DELALANDE, F., COSTA, D., RAZAKANDRAINIBE, R., FAVENNEC, L., AUBERT, D., VILLENA, I., ARIEY, F., LA CARBONA, S. Réponse aux stress des oocystes de toxoplasme :  étude transcriptomique. Société Française de Parasitologie, 21-23 juin 2022, Rouen. Communication orale.
• LA CARBONA, S. Progress towards validation of molecular detection methods in food: Focus on protozoan parasites. Congrès national de la Société de Parasitologie Italienne, 27-30 juin 2022, Naples. Communication orale.
• AUGENDRE, L., ESCOTTE-BINET, S., AUBERT, D., SILVESTRE, A., REPERANT, J.M., VILLENA, I., DUMETRE, A., LA CARBONA, S. Evaluation of Eimeria spp. parasites as surrogates for the study of Toxoplasma gondii oocyst inactivation. ApiCowplexa 2022, 05-07 octobre 2022, Berne, Suisse. Communication affichée.
• AUGENDRE, L., ESCOTTE-BINET, DUMETRE, A., LA CARBONA, S., AUBERT, D., VILLENA, I. Les protozoaires surrogates: un enjeu pour la santé publique. Journée Rémoise des Jeunes Chercheurs en Santé, 20 octobre 2022, Reims. Communication affichée.
• CHASSAING, M., BOUDAUD, N., GANTZER, C. Interaction between norovirus and histo-blood group antigens: is there a protective effect against pH and proteolytic enzymes ? International Society for Food & Environmental Virology, mai 2022, Saint Jacques de Compostelle, Espagne. Communication orale.
• DO NASCIMENTO, J., PALOS LADEIRO, M., LOPES, C., BOUDAUD, N., GANTZER, C., GEFFARD, A. Use of a sentinel species to measure the viral hazard in continental water bodies. ECOBIM Conference, mai 2022, Namur, Belgique. Communication orale.
• DO NASCIMENTO, J., PALOS LADEIRO, BONNARD, M., BOUDAUD, N., LOPES, C., GANTZER, C., GEFFARD, A. Interactions entre dreissènes et phages ARN-F spécifiques : intérêt pour l’évaluation de la qualité des masses d’eau. Colloque PIREN Seine, octobre 2022, Paris. Communication orale.
• HANIN, A., LEVERT, D., SOUMET, C., BRIDIER, A., ROUSSET, N., TRAVEL, A. Etude de la capacité des détergents enzymatiques à lutter contre les biofilms d’Escherichia coli. Journées de la recherche avicole et palmipèdes à foe gras. 9-10 mars 2022, Tours. Communication affichée.
• HANIN, A., LEFEVRE, M., VISCONTI, V., DUQUE, B., DEHAINE-ZOUAGHI, S., PICOCHE, B. Impact of environmental and application conditions on the inactivation of dry fungal spores by disinfectants. Fouling and Cleaning in Food Processing, 30 mars 2022. Communication orale.
• HANIN, A., LEFEVRE, M., VISCONTI, V., DUQUE, B., PICOCHE, B. Impact of the physiological state of mold spores on their resistance to chlorinated disinfectant. Fouling and Cleaning in Food Processing, 30 mars 2022. Communication affichée.
• HUBERT, A., ROSSI, N.,  ZOUAGHI, S, MICHEL, V., GUILBAUD, M., HERRY, J-M, HANIN, A., JARD, G., TORMO, H., PERION, R., MORAZIN, A., POULET, J-L., OULAHAL, N., LAITHIER, C. Design and development of a pilot milking machine: monitoring  fouling and cleaning  under real conditions. Fouling and Cleaning in Food Processing, 30 mars 2022. Communication orale.
• DUQUE, B., GRAVEY, F., BRAUGE, T., LEFEVRE, M., SONNET, E., LELEU, G., LE HELLO, S., SOUMET, C., BRIDIER, A., MIDELET, G., HANIN, A. Whole genome sequencing-based typing of Listeria monocytogenes isolated from seafood and production environments. IAFP’s European Symposium, 4-6 mai 2022, Munich, Allemagne. Communication affichée.
• DENIS, C., HANIN, A., LEFEVRE, M., DESVAUX, M., GUILLIER, L. Modelling the impact of a microbial consortium of soft cheese on the growth of Listeria monocytogenes and E. coli O157:H7. IAFP’s European Symposium, 4-6 mai 2022, Munich, Allemagne. Communication affichée.
• DUQUE, B., GRAVEY, F., BRAUGE, T., LEFEVRE, M., SONNET, E., LELEU, G., LE HELLO, S., SOUMET, C., BRIDIER, A., MIDELET, G., HANIN, A. Whole genome sequencing-based typing of Listeria monocytogenes isolated from seafood and production environments. IAFP’s Annual meeting, 31 juillet-3 août 2022, Pittsburgh, Pennsylvania, Etats-Unis. Communication affichée.
• HANIN, A. Optimisation des procédures de désinfection pour réduire le gaspillage alimentaire lié au développement de moisissures. 17ème congrès national de la SFM, 3-5 octobre 2022. Communication orale invitée.