01-09-2022
Surveillance de la dynamique des variants du SARS-CoV-2 dans les eaux usées brutes en France
Tout au long de la pandémie de COVID-19, de nouveaux variants ont continuellement émergé et se sont propagés dans les populations. Parmi ceux-ci, les variants préoccupants (VOC) ont été les principaux responsables des vagues épidémiques successives, en raison de leur transmissibilité, de leur pathogénicité ou de leur capacité à échapper à la réponse immunitaire.
Une nouvelle publication scientifique est parue dans la revue « Science of The Total Environnement ». Cette publication visait à dater l’émergence des variants préoccupants du SARS-CoV-2, d’Alpha au sous variant BA.2 d’Omicron, en surveillant les eaux usées de la région parisienne et de quelques villes en province. Il s’agissait aussi de modéliser la dynamique de propagation de ces variants et de caractériser la cinétique de remplacement des populations prévalentes.
Wurtzer, S., Lever,t M., Dhenain, E., Accrombessi, H., Manco, S., Fagour, N., Goulet, M., Boudaud, N., Gaillard, L., Bertrand, I., Challant, J., Masnada, S., Azimi, S., Guillon-Ritz, M., Robin, A., Mouchel, J.M., OBEPINE SIG, Moulin, L. (2022). Monitoring of SARS-CoV-2 variant dynamics in wastewater by digital RT-PCR: from Alpha to Omicron BA.2 VOC. Science of The Total Environnement, 848: 157740. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.157740
Ce travail a été effectué dans le cadre du réseau OBEPINE et de l’UMT Actia VIROcontrol